Wytwarzanie substancji leczniczych
Wytwarzanie większości substancji swoistych jest właściwością komórek młodych, będących w fazie intensywnych przemian (alkaloidy, olejki). Miejsce syntezy i miejsce gromadzenia czynnych substancji są zazwyczaj różne, np. alkaloidy tropanowe są syntezowane w korzeniach i transportowane do części nadziemnej. Obserwując filogenetyczny rozwój świata ożywionego, widzimy, że niższe organizmy roślinne nie są na ogół zdolne do syntezy ani do magazynowania wtórnych produktów przemiany materii, chociaż bakterie stanowią tu wyjątek. Bliższe badania wykazują, że wiele wtórnych produktów przemiany materii, uważanych dotąd za typowe dla świata roślinnego, występuje również w świecie zwierzęcym (terpenoidy, alkaloidy). Sporna jest rola fizjologiczna substancji czynnych w roślinie. Dawniej przypisywano im znaczenie ekologiczne, jako substancjom przywabiającym owady, chroniącym przed zjadaniem przez zwierzęta itp. albo jako substancjom zapasowym. Obecnie proces ich powstawania łączy się raczej z detoksykacją organizmu, który wiążąc i izolując nadmiar pewnych substancji powstających w wyniku procesów życiowych organizmu, zapobiega przez to ich szkodliwemu działaniu. Duży udział w syntezie ciał czynnych, jak i ich rozkładzie, biorą enzymy. Trzeba przyznać, że badania nad rolą fizjologiczną czynnych substancji w życiu rośliny są trudne i stosunkowo mało rozwinięte. Szuka się zazwyczaj prostej formuły biosyntezy, występowania i roli tych związków, tymczasem w roślinie proces ten przebiega zazwyczaj jako skomplikowany system reakcji, który może być wymienny, kompensowany, może iść kilkoma na raz drogami i ulega przy tym dużym wahaniom pod wpływem różnych czynników i bodźców zarówno zewnętrznych, jak i wewnętrznych.